PCR-Pooltests bis 30 Teilnehmer: Unterschied zwischen den Versionen

Aus Erlangen gegen Corona
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* Codebestandteile
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** Codierung: [https://de.wikipedia.org/wiki/Code128 Code128]
** Codierung des Barcodes: [https://de.wikipedia.org/wiki/Code128 Code128]
** Identifikationselement zur Unterscheidung unterschiedlicher Codes
** Identifikationselement zur Unterscheidung unterschiedlicher Codes
*** P: Poolprobe
*** P: Poolprobe

Version vom 27. Dezember 2020, 08:31 Uhr

Stichworte

  • Screening Pools, Screeningpools, Megapools

Vorgeschichte

  • Bericht über Pilotversuch an der Bavarian International School
  • https://www.rtlamp.org/
    • Aktivitäten der Uni Wien und angeschlossener Forschungsinstitute zu schnellen kostengünstigen Testverfahren für Pools (RT-LAMP, bead LAMP, qPCR)

Implementation von qPCR-Pooltests (bis 30 Personen) in Erlangen ab Januar 2020

Zusammenfassung und Vorbemerkungen

  • Die Auswertungen erfolgen in einem Labor der Sicherheitsstufe 2 an der FAU.
  • Nach Plan werden wir am 7.1.21 alle Materialien verfügbar haben und bis 25.1.21 20 anfänglich mindestens 20 Poolproben pro Werktag messen können, was dann auf ca 100 pro Werktag ansteigen wird.
  • Wir werden ausschließlich Poolmessungen für Screeningzwecke mit bis zu 30 Leuten durchführen (also keine Individualdiagnostik anbieten), keinen Arzt einbinden und planen keine wissenschaftliche Veröffentlichung.
  • Durch die Poolung können wir damit pro Werktag 600 bis 3000 Personen im Rahmen von Gruppentests screenen. Die Abnahme erfolgt über modifizierte Rachenspültests. Technisch kommt ein qPCR Test zum Einsatz (kurz gesagt ist das ein schnellerer PCR-Test bei dem nur ein ja/nein Ergebnis und keine Viruskonzentration ermittelt wird). Das qPCR-Verfahren selbst dauert ca 1h 10 Min.
  • Die Poolverwaltung, Benachrichtigung der Teilnehmer und ggf. Veranlassung von Nachtestungen positiver Pools auf konventionellem Weg erfolgt in den und in der Verantwortung der jeweiligen Firmen.
  • Als Fahrplan ist grob geplant, die Abläufe ab Beginn mit zwei bereits festgelegten Erlanger Firmen (Intego GmbH und Evosys Laser GmbH) zu testen. Hierzu würden Teilnehmer morgens einen Rachenspültest von zu Hause mit Wasser in einem wiederverwendbaren Schraubgefäß vordosiert mitbringen. Die Proben werden dann im Außenbereich der Firmen in einem Einweg-Transportgefäß gesammelt, bis 11 Uhr in die Uni gebracht und dort ausgewertet.
  • Eine Testung aller teilnehmenden Personen erfolgt zweimal wöchentlich (Frequenz ist wissenschaftlich begründetes Optimum).
  • Ab ca 25.1. wäre das Verfahren für weitere Firmen offen. Es ist angedacht, dass sich teilnehmende Firmen mit einer Monatspauschale engagieren, um damit einen Teil der Testkapazität kostenfrei für Schulen, Altenheime o.ä. zur Verfügung stellen zu können. Die Pauschale ist noch festzulegen liegt dabei sicher unter 1 EUR pro Mitarbeiter und Test.
  • Es gibt Überlegungen, eine Teilauflösung positiver Pools in kleinere Gruppen hinzuzufügen, dazu muss man aber Praxiserfahrungen abwarten.

Umsetzungsdetails

Verwendete Materialien für zu Hause

Verwendete Materialien in der Firma

Details zu Beschriftungen

  • Beschriftet werden
    • Die 125 ml Becher der Einzelpersonen
    • Die Falcon Tubes der Einzelpersonen
    • Die 125 ml Becher zur Abgabe der Poolproben
  • Codebestandteile
    • Codierung des Barcodes: Code128
    • Identifikationselement zur Unterscheidung unterschiedlicher Codes
      • P: Poolprobe
      • E: Einzelperson
    • Firmenname
      • mit zwei Buchstaben codiert, aus Verwechslungsgründen werden I, J und O nicht verwendet
    • Laufende Nummer für Poolprobe der Firma, zunächst 2 Ziffern, startet mit 01
    • Laufende Personennummer in der Firma, zunächst 3 Ziffern, startet mit 001
    • Codebeispiele
      • XY-P-07: Siebte Poolprobe der Firma mit dem Kürzel XY
      • XY-E-019: Gefäß, das der Person mit Nummer 19 in der Firma mit dem Kürzel XY gehört
  • Hinweise zum Aufkleben
    • Die Barcodes bitte immer senkrecht auf dem runden Gefäß aufbringen, damit der Barcode auch mit einem Scanner gelesen werden kann (auf krummen Oberflächen geht das schlechter)
  • Beispiele von Druckvorlagen
  • Poolbarcodes. Hiermit werden die abzugebenden Sammelproben beschriftet.

    Poolbarcodes. Hiermit werden die abzugebenden Sammelproben beschriftet.

  • Einzelprobenbarcodes. Hiermit wird die Rückstellprobe jeder Personen beschriftet. Die Rückstellprobe bleibt in der Regel bei der Person. Nur bei der Nachuntersuchung positiver Pools wird die Rückstellprobe eingeliefert.

    Einzelprobenbarcodes. Hiermit wird die Rückstellprobe jeder Personen beschriftet. Die Rückstellprobe bleibt in der Regel bei der Person. Nur bei der Nachuntersuchung positiver Pools wird die Rückstellprobe eingeliefert.

Probennahme zu Hause

  • Die Proben werden in der Regel in jeder Firma zweimal wöchentlich an festgelegten Werktagen genommen.
  • Der Proband nimmt die Gurgelprobe zu Hause morgens direkt nach dem Aufstehen, weil Essen und Trinken die Virenkonzentration verringern.
    • Wird die Probe ausnahmsweise tagsüber genommen, darf man vorher 2 Stunden nicht Essen, Trinken oder Rauchen.
    • Hat man die Probe morgens vergessen und kann sie nicht mehr rechtzeitig (unter Einhaltung der 2-Stunden-Regel) nehmen, dann bitte einmalig keine Probe abgeben, weil falsch genommene Proben den Pool stören können
  • Der Proband misst zunächst ungefähr 5-7 ml Leitungswasser in der Falcon Tube ab.
    • Zu viel Wasser verdünnt unnötig, zu wenig Wasser lässt nicht genügend Material für die Rückstellprobe
  • Der Proband gurgelt mit dem Wasser mindestens 30s, bis zu 60 s, dabei darf man natürlich zum Luft holen unterbrechen.
  • Der Proband spuckt das Wasser dann in das 125 ml Gefäß
  • Der Proband entnimmt ca 2 ml der Gurgellösung mit der Pipette in die Falcon Tube
  • Der Proband verschließt 125 ml Becher und Falcon Tube, packt beides in eine Tüte und nimmt das Material in die Firma mit
  • Hinweise:
    • Beim Gurgel entstehen Aerosole, deshalb nicht in der Nähe anderer Personen gurgeln
    • Arbeitsflächen nachher reinigen

Mitnahme weiterer Proben aus dem Haushalt

  • Falls die Firma dies zulässt, können mit demselben Verfahren Proben weiterer Personen aus dem Haushalt genommen werden
    • Der Vorteil für die Firma besteht darin, dass das Umfeld eines Mitarbeiters mit gescreent wird und so Infektionen erkannt werdne können, bevor sie in der Firma landen
    • Der Vorteil für die Familie des Mitarbeiters besteht im kostenfreien Screening der Familie
  • Jede Person hat dabei eigene, persönliche Probenmaterialien und eine eigene Personennummer
  • Alle Personen eines Haushalts sollten in der Firma in einen Pool wandern

Probenabgabe in der Firma

  • In der Firma leert der Mitarbeiter nur die 2 ml Probe aus der Falcon Tube in einen bereitstehenden Poolbehälter
    • bei der Abgabe berührungsfrei arbeiten
    • Pooldeckel sollte offen sein, sodass man ihn nicht berühren muss
    • Falcon Tube beim Außgießen nicht auf dem Probenbehälter aufsetzen
    • Mögliche verschüttete Reste nicht selbst entfernen, diese werden am Ende zentral gesäubert
    • sauber arbeiten
    • Sofern der Proband Proben weiterer Haushaltsmitglieder dabei hat, leert er diese ebenfalls möglichst in denselben Pool
  • Sind mehrere Poolbehälter aufgestellt, verwendet ein Mitarbeiter möglichst jedesmal denselben Pool und merkt sich (z.B. durch Handyfoto des Barcodes) die Poolnummer, in die er abgegeben hat
  • Nach Abgabe der Probe Handdesinfektion!
  • Die leere Falcon Tube und den noch vollen 125ml Becher wieder in der Transporttüpte verstauen und nach Hause nehmen
    • Nur zu Hause reinigen und Materialien am nächsten Tag wieder verwenden
  • Die Firma ist für die Dokumentation der Poolzusammensetzung verantwortlich
    • Sinnvollerweise jeden Mitarbeiter einem festen Pool zuordnen
    • Pools so aufteilen, dass Mitarbeiter zusammengefasst werden, die miteinander arbeiten
    • Der Pool muss nicht auf 30 Personen aufgefüllt werden, wenn jemand einmal nicht teilnehmen kann, hat der Pool eben an diesem Tag weniger Mitglieder. Dies sollte jedoch dokumentiert sein (Mitarbeiter meldet der Firma Nichtteilnahme)
    • Werden mehrere Pools eingesetzt, diese möglichst gleichgroß halten.
  • Nach Abgabe aller Proben
    • mit Einweghandschuhen arbeiten
    • den Probenbehälter verschrauben, außen desinfizieren und in eine Transporttüte packen
    • Die Arbeitsfläche desinfinzieren
  • Ggf. Sonderpool für verdächtige Poolteilnehmer
    • Falls ein Familienmitglied eines Mitarbeiters am Pool teilnimmt, aber plötzlich erkrankt oder Kontaktperson 1 wird, kann die Probennahme weitergehen, die Proben sollten dann jedoch in eines separaten Pool wandern

Transport der Pools zum Auswertezentrum

  • Verpackte 125 ml Becher in weiterer Umverpackung transportieren
  • Abgabe bis 11 Uhr in der FAU, Professur Mikrobiologie Porf. Burkovski

Benachrichtigung zu Poolergebnissen

  • Die Benachrichtigung erfolgt durch Email an eine Sammeladresse in der Firma noch am selben Arbeitstag

Was tun bei positivem Pool?

  • Eine Benachrichtigung über einen positiven Pool erfolgt über einen vorher festgelegten Emailverteiler innerhalb der Firma.
  • Kommt die Meldung dass ein Pool positiv ist, sollte mit Hilfe der Rückstellproben noch am selben Tag durch Gewinnung weiterer Unterpools die Infektion weiter eingegrenzt werden.
  • Die Mitarbeiter können normal weiterarbeiten, eine vermehrte Verwendung von FFP2 Masken bis zur Klärung wird aber empfohlen
  • Alle Poolteilnehmer geben Möglichs umgehend ihre Gefäße mit den Rückstellproben (125 ml-Becher) in der Umverpackung (Falcon Tube vorher entnehmen) an einem zentralen Sammelort in der Firma ab.
  • Die Proben werden in sinnvollen kleineren Pools (z.B. vier Personen, Haushalte o.ä.) in einem weiteren Testdurchlauf am selben Tag ausgewertet, um die Infektionsquelle einzugrenzen.
    • Die Entnahme der 2ml Proben aus den Rückstellproben erfolgt im zentralen Auswertelabor und man erhält anschließend ein neues 125 ml Gefäß
  • Das zentrale Auswertelabor gibt in direkten Austausch mit der Firma Informationen zum betroffenen Teilpool
  • Die möglicherweise betroffenen Teilpoolpersonen sollten den Arbeitsplatz bis zur Klärung verlassen und einen Arzt für eine kurzfristige Testung aufsuchen, ggf zusätzlich auch Rachenspültest durchführen
  • Wichtiger Hinweis: Eine Meldung eines positiven Poolergebnisses oder Teilpoolergebnisses an das Gesundheitsamt erfolgt NICHT, da hier ja (ähnlich wie bei der Testung im Abwasser) keinen Individualtests vorliegen.

Umsetzungsstatus

  • 2020-12-23:
    • Die ersten Bestellungen sind ausgelöst, wir rechnen damit, dass wir am 7.1. mit ersten internen Tests beginnen können
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